Родился в 1904 году в Тверской губернии в семье крестьянина. Трудным было его детство. Погиб на фронте отец. Десятилетний мальчик остался в семье за кормильца. В 1924 году Петр Лабутин приехал в Ленинград. Работал подсобником в булочной. Жил он на улице Жуковского в доме № 47. В 1924 году переехал в Ленинград, работал подсобным рабочим в булочной, жил в доме № 47 по улице Жуковского.
6 сентября 1941 года добровольцем (призыву не подлежал, по причине отсутствия двух пальцев на руке), в составе 6-й Ленинградской стрелковой дивизии народного ополчения Октябрьского района, 23 сентября 1941 года переименованной в 189-ю стрелковую дивизию, отправился на фронт.
Зачисленный в саперный батальон 189-й стрелковой дивизии, Петр Лабутин быстро освоил специальность сапера, изучил способы установки мин, правила обращения со взрывчаткой.
Дивизия с 1941 года занимала оборону в Пулково, в районе Пулковской обсерватории. П. И. Лабутин в боях был ранен, лечился в госпитале, затем снова вернулся в дивизию.
В ночь с 12 на 13 сентября 1942 года 269-я отдельная разведывательная рота производила разведку боем переднего края противника в районе деревни Верхнее Кузьмино. На красноармейцев Лабутина и Короткова была возложена задача подготовки проходов в заграждениях для разведчиков. Когда разведчики приблизились к переднему краю противника, они пошли в атаку. Красноармеец Лабутин принял участие в атаке вместе с разведчиками. Неожиданно с фланга начал вести огонь пулемёт противника, в результате чего в рядах советских бойцов возникло замешательство и появились потери. Красноармеец Лабутин, вооружившись единственной гранатой, подобрался к пулемёту и бросил гранату. Пулемёт на некоторое время умолк, но вскоре снова заработал. Тогда Лабутин, подобравшись к пулемёту, и схватившись за ствол рукой, начал отводить его. В этот момент был убит пулей в сердце, и упал на амбразуру, закрыв её телом.
Тело бойца было вытащено с поля боя и похоронено в братской могиле в селе Пулково.
За подвиг был посмертно представлен к званию Героя Советского Союза, представление было поддержано вплоть до Военного совета 42-й армии, но награждён был только орденом Красного Знамени.
Подвиг сапёра был описан в журнале «Смена» № 371—372, ноябрь 1942 года.
Именем Лабутина в 1965 названа улица (бывшая Прядильная) в Ленинграде, на доме № 2 установлена мемориальная доска: «Лабутин Петр Иванович. Родился в 1904 году, ленинградский рабочий. В грозные дни обороны Ленинграда вступил в народное ополчение и 13 сентября 1942 года при выполнении боевой задачи на Пулковских высотах грудью закрыл амбразуру вражеского дзота. Вечна» слава герою».